一种理论认为水怪其实是存活着的蛇颈龙，这种长脖子的爬行动物广泛存在于侏罗纪时期。据称它们在白垩纪时期逐渐灭绝。
皮卡迪博士认为目击水怪很可能与湖底产生的水泡有关，后者是由尼斯湖所处的大峡谷断层系统产生的地震活动所致。尽管人们并不经常将苏格兰与地震相联系，但皮卡迪表示地下的断层线“非常大且非常活跃。”
这名地质学家说道：“尼斯湖水面产生的各种效应都可能与断层处的活动有关。” 皮卡迪博士援引了阿德曼撰写的有关爱尔兰传教士圣哥伦巴(Saint Columba)的古老传记，传记描述了在地球震动时怪兽的出现和消失的情节。
这篇写于公元690年的传记描述了有关圣哥伦巴经过尼斯河时发生的故事，他的门徒被怪兽攻击，他在向上帝祈求庇护后他的门徒被拯救了。现在很多人认为这一描述非常模糊，只提到了拥有响亮的咆哮声的“未知猛兽”。它并没有提供有关存在湖底上升的水泡，或者居住在尼斯湖底的古代怪兽的任何科学解释。这些描述也没用引用任何之前提到的怪兽目击事件，但它却提到了地球晃动，这使得皮卡迪博士非常感兴趣。
皮卡迪博士表示在20世纪30年代存在大量尼斯湖水怪目击事件，而这恰好与大峡谷断层系统地震活动的事件相一致。“我认为这是真正发生过的事件的明确描述…断层处日益增加的地震活动，在现实中人们在水面上看到了地震产生的效应。”他认为他的理论可以用于解释将近3500起尼斯湖水怪目击事件。
现在存在很多有关尼斯湖水怪的理论，从而产生了很多著名的图片，例如这张图。其中最容易让人接受的解释便是尼斯湖水怪其实是一条巨大的鲟鱼，它身长12英尺(3.66 米)。
ß地质学家表示在尼斯湖区域曾经发生过3-4里氏震级的地震。记录的最大地震分别发生于1816年，1888年，1890年和1901年。与皮卡迪博士的观点不同，有的地质学家认为地震与20世纪30年代出现大量的目击事件在时间上并不一致。他们认为苏格兰最猛烈的地震也太过微弱，无法引起尼斯湖水面产生可观察到的波纹。
这名意大利地质学家小心翼翼的指出，他认为他的假设的价值在于让地质学家意识到某些神秘之谜的地质学起源。他还声称德尔菲的神谕( Oracle of Delphi)就是由硫磺气体造成的。
